位于霍城县惠远镇东大街。清光绪八年（1882）清政府收复伊犁后，在惠远老城北重建惠远城。伊犁将军府也于光绪十年（1884）在新城中重建。其址位于城内钟鼓楼东大街正中，坐北朝南，门院三重，为典型的中轴线布局，依次为府门、正殿、将军亭，两侧有东西营房、客房、书房；西有一四合院，包括办公室和居室等，四合院后为金库。伊犁将军府是清代管理西北边疆的最高军政机构，以军府而兼理民政。新疆建省后，省会设于迪化（今乌鲁木齐），新疆的政治军事中心东移，但伊犁将军仍掌管着边疆军务。辛亥革命后废除清制，伊犁将军府成为新伊大都督府，后改为伊犁镇边使署。1914年，改为伊犁镇守使署。1930年，改为伊犁屯垦使署。1934年秋，屯垦使署迁往伊宁，伊犁将军府遂被弃用。

　　1996年7月公布为全国重点文物保护单位。2002年开始经全面修缮保护，2006年对外开放。2012年实施免费开放。